Вчера вечером вдумчиво перечитал то, что сделано....
Грохнул все и сделал по новой, как писал ранее, только диски наоборот.:
mdadm --create /dev/md2 --level=1 --raid-devices=2 /dev/sda3 /dev/sdb3
mdadm --create /dev/md3 --level=linear --raid-devices=2 /dev/sda4 /dev/sdb4
После последнего презагруза хранилище увидело раздел. Но только один, который второй побольше и jbod. При чем, я для себя выяснил, что папочки /volumeN оно генерит на лету. И монтирует каким-то своим скриптом, который отрабатывает в том числе и при рестарте. Сделанные в ручную папочки оно не видит. Так вот оно увидело и сделало. volume2. Все правильно jbod (/dev/md3) шел вторым по орчереди. А вот зеркало (/dev/md2) не видится вупор....... 
а до этого тома были созданы ? наверно проще будет не разбиратся в особенностях настройки синалоджиков а создать два каких-либо тома через вебку, размонтировать их в консоли, стопорнуть и убрать их через mdadm, пересоздать уже нужные разделы и загнать их в тома.
До этого - до чего? До моих mdadm'ов? Я там в начале написал, что сначала убил то, что было создано synology ее утилитами. Если пытаться этого не делать, то:
1). Так как оно создает само только один раздел, то не вижу смысла
2). В это случае я натыкаюсь на то, что при попытке размонтировать раздел - кто-то его держит. По всей видимости синолоджиковский софт. То есть его надо ловить-фьюзерить, отстреливать, не известно на сколько это можно делать. А с учетом 1) и вовсе не нужно.
Все-таки как-то надо понять, где оно держит конфиг свего разбиения дисков
, просто квотированием не пользуюсь, но может тебе поможет.